Mikroskop cyfrowy to przyrząd zawierający nie tylko układ optyczny, ale też kamerę z przetwornikiem CCD (Charge-Coupled Device) – umożliwia ona oglądanie cyfrowego obrazu preparatu na wbudowanym lub zewnętrznym ekranie. Mikroskopy cyfrowe wyświetlają obraz nawet najmniejszych preparatów z najwyższą ostrością i w żywych kolorach. Są one stosowane w badaniach laboratoryjnych w różnych dziedzinach, w tym w medycynie, biologii i chemii.